Разрешение на строительство Никольской единоверческой церкви на углу Грязной (Марата) улицы и Кузнечного переулка в 1819 году дал Александр I. Автором проекта стал Авраам Мельников, храм строился с 1820 по 1827 год.

В 1832 году в память об избавлении Санкт-Петербурга от холеры при Никольской церкви были построены две часовни.

В 1832 году церковь закрыли и отдали Театру рабочей молодёжи. Театр разместил здесь свои мастерские. В 1934 году здание занял Музей Арктики. Для нужд музея здание три года перестраивали. Многие внутренние помещения были разделены, башенки венчавшие углы основного объёма и купол оказались снесены, лоджии-колоннады заложили и застеклили. Музей Арктики открылся в 1937 году. На тот момент он стал единственным подобным музеем в мире. Сюда поместили палатку Папанина с первой дрейфующей станции Северный полюс . В конце 1950х заведение стало называться Музеем Арктики и Антарктики. Работает оно и сейчас. Кроме палатки Папанина здесь находятся сани из экспедиции Роберта Скотта, штурвал ледокола Ермак .

Одна из часовен была отдана верующим в 1993 году, в 1994 году она была отреставрирована. Во второй часовне до сих пор размещена трансформаторная будка.